Обичне аминокиселине и синтеза протеина
Аминокиселине које се најчешће појављују у протеинским структурама живих организама називају се обичне или протеиногене аминокиселине. Иако је у природи познато преко 500 врста аминокиселина, постоји само двадесет које називамо обичним. Уз њих, постоје и неки ређи, названи повремени, који углавном потичу од метаболизма обичних након њиховог укључивања у ланац протеина. У колагену, на пример, лизин и пролин, две обичне аминокиселине, налазе се у хидроксилисаном облику (хидроксипролин и хидроксилзин).
Већина других необичних аминокиселина углавном спадају у састав ензима и хормона протеинске природе, или боље речено пептида (запамтите да се протеин сматра таквим, а мора се састојати од више од 100 аминокиселина. формирају олиго и полипептид 2 до 9 и 10 до 100 су довољни).
Међу 20 обичних аминокиселина се памте
Аланин, Аргинин, Аспарагин, Аспарагинска киселина, Цистеин, Глицин, Глутаминска киселина, Глутамин, Хистидин, Изолеуцин, Леуцин, Лизин, Метионин, Фенилаланин, Пролин, Серин, Треонин, Триптофан, Тирозин, Валин
Примери необичних аминокиселина су:
карнитин (укључен у транспорт дуголанчаних масних киселина унутар митохондрија, где се користе за производњу енергије);
орнитин, цитрулин и хомоцистеин (учествују у метаболизму аминокиселина - циклус урее);
хидроксипролин и хидроксилзин (део су састава колагена и неких протеина);
саркозин (или метилглицин).
Неке аминокиселине такође могу имати комерцијални или фармаколошки значај.
- Натријум глутамат се користи у прехрамбеној индустрији као појачивач укуса (види коцку бујона).
- Л-дихидроксифенилаланин (Л-ДОПА) је лек који се користи за лечење Паркинсонове болести.
- 5-хидрокситриптофан (5-ХТП) је коришћен за лечење неуролошких симптома повезаних са фенилкетонуријом (наследном метаболичком болешћу која спречава употребу фенилаланина, есенцијалне аминокиселине, због посебних ензимских дефицита; накупљање фенилаланина у ткивима одговоран је за тешка кожна и неуролошка оштећења).
Биљке и бактерије могу произвести одређене аминокиселине које се могу наћи у пептидним антибиотицима, попут нисина и аламетицина.
Есенцијалне аминокиселине
Неке од 20 обичних аминокиселина називају се есенцијалним, јер их тело не може синтетизовати из других једињења, већ се морају узимати храном.
За људе, то су фенилаланин, леуцин, изолеуцин, лизин, метионин, треонин, триптофан, валин, а код деце хистидин и аргинин.
Обичне аминокиселине, хемијске карактеристике
На основу хемијских карактеристика Р радикала (група атома који формирају не баш дугачак ланац), аминокиселине се могу поделити у различите категорије.
Аминокиселине са аполарним Р (не могу да формирају водоничне везе):
са алифатским ланцем: аланин, леуцин, изолеуцин, валин, пролин
са ароматичним ланцем: фенилаланин, триптофан
са ланцем који садржи атом сумпора: метионин
Аминокиселине са поларним Р:
са ОХ групом: серин, треонин, тирозин
са СХ групом: цистеин
са ЦО-НХ2 групом: аспарагин, глутамин
са Х: глицин (једина нехирална аминокиселина)
Аминокиселине са базичним Р:
лизин, аргинин, хистидин
Аминокиселине са киселином Р:
глутаминска киселина, аспарагинска киселина